دولت کلانشهری توکیو مسئول خدمات عمومی بزرگمقیاس مانند آب، فاضلاب و بیمارستانهای دولتی است. در زیرمجموعهٔ آن، ۲۳ ناحیه و مجموعهای از شهرها و شهرکهای پیرامونی قرار دارند. هر شهرداری، شهردار و شورای منتخب خود را دارد و مسئول خدماتی چون مدارس، مدیریت پسماند و برنامهریزی محلی است.